液相色谱柱的主要基质的特点：
1、硅胶
硅胶是陶瓷性质的无机物基质，刚性大，不易变形。化学性质较稳定，但对于水溶液尤其碱性水溶液仍然是不稳定的，即使表面经过良好的化学键合，覆盖了固定液，还是要注意水、碱性溶液、酸性溶液对硅胶的溶解作用，基质或者说是柱床溶解对色谱柱的影响是致命的。以硅胶为基质的填料构成了目前绝大多数的色谱柱填料。纯硅胶填料适宜分离溶于有机溶剂的极性、弱极性的非强离解型的化合物，硅胶也可以做凝胶色谱但柱效较低。硅胶基质键合固定相的高压液相填料，有其他填料*的高分离效能。
2、二氧化铝
二氧化铝和硅胶相似，但对水溶液、酸性碱性水溶液溶液更加不稳定。所以，极少用作键合固定相的基质，也是适宜分离溶于有机溶剂的极性、弱极性的非强离解型的化合物，尤其是分离芳香族碳氢化合物。酸性易离解的化合物容易在二氧化铝上形成死吸附。另外，氧化铝分离几何异构体能力优于硅胶。
3、聚合物填料
聚合物基质受压会变形，压力限度低但pH使用范围宽。苯乙烯-二乙烯苯基质疏水性强，使用任何流动相，在整个pH范围内稳定，可以用强酸、强碱来清洗色谱柱。甲基丙烯酸酯基质比苯乙烯-二乙烯苯疏水性更强，但可以通过适当的功能基修饰变成亲水性的。由于不耐压、有溶胀性，所以聚合物填料适宜用于大分子像蛋白质或合成的高聚物，另外还可以制成分子排阻、离子交换柱。近年发展迅速的大孔树脂，实际上主体就是苯乙烯-二乙烯苯聚合物或类似的合成高聚物。
液相色谱柱保养
(1)至少每天进行一次检漏。
(2)泵正在带压工作时，不可拆卸其部件(除非有经验的维修人员在进行故障处理)。
(3)配制两种或两种以上洗脱液时，一定要先脱气再使用，保证流动相系统中不要形成气泡。
(4)定期检查泵的润滑，只使用仪器说明书*的润滑油。
(5)定期检查检测器噪声、漂移，定期进行检测器校正。
(6)除非实践证明其它纯度级别的溶剂可用，否则使用液相色谱流动相专用试剂。
(7)更换溶剂时，一定要对系统进行冲洗。如果两种溶剂互不相溶，则应先用与这两种溶剂都能互溶的溶剂进行冲洗，再用新溶剂进行冲洗。
(8)柱子不论何时都不能拆卸下接头，以免损失柱效，废掉柱子。
